289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1244 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  45.61 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.78 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  38.74 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  39.66 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.7 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.03 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  41.12 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  42.71 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  38.46 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  31.19 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  33.66 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  32.67 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  36.63 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 115 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  27.62 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  39.82 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  29.36 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  38.33 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  31.48 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  27.62 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  27.62 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0913  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.197337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  28.32 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  33.04 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  27.88 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 105 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  32.38 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  38.61 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  33.62 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  28.83 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  37.62 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  29.13 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  36.63 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  31.31 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  33.01 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  31.53 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  28.44 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  28.44 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35.04 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  28.44 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>