255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2613 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  96.52 
 
 		 115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  95.65 
 
 		 115 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  93.91 
 
 		 115 aa  215  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  96.52 
 
 		 114 aa  213  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  94.78 
 
 		 114 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  94.78 
 
 		 114 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  94.78 
 
 		 114 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  94.78 
 
 		 114 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  62.96 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  48.15 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  51.06 
 
 		 120 aa  105  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  51.35 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  46.9 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  53.19 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  49.52 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  47.22 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 109 aa  93.6  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  51.46 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  37.36 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  35.19 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  33.64 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  36 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09510  transcriptional regulator, PadR family  37.86 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.498358  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  34.12 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  39.8 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  30.28 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1203  lineage-specific thermal regulator protein  38.71 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230891  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  39.76 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  40.66 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  40.66 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 123 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3469  hypothetical protein  38.37 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0557218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  42.5 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  38.37 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  39.33 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1072  lineage-specific thermal regulator protein  37.63 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  42.11 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>