263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1533 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  48.31 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  49.53 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  45.95 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  44.35 
 
 		 115 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  52.13 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  52.13 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 115 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  51.06 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  47.75 
 
 		 113 aa  104  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  42.86 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  47 
 
 		 111 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  45 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 109 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  46.79 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  47.47 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.61 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  36.89 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  33.33 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  34.51 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  35.19 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  42.11 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  34.19 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  30 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  41.3 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  30.1 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  30.1 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  32.61 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.78 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>