More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0735 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  42.31 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  41.35 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 119 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 110 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34 
 
 		 110 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38.83 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  37.27 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  35.58 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  40.59 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 114 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  34.86 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  28.44 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  39.22 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  38.68 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  37.25 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3603  PadR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0899906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  34.58 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  32.04 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  37.27 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  33.96 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  33.66 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.96 
 
 		 114 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  32.71 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  33.33 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  31.78 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  32.69 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.67 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.67 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.67 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1707  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.28683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  31.53 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  32.65 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31.43 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31.43 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>