More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3025 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  50.45 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  56.31 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  49.47 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  44.66 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  37.38 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 110 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  34.91 
 
 		 110 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 110 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  37.11 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  43.9 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  40.96 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  30.28 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  33.65 
 
 		 108 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.23 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  32.58 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  32.99 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0782  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  32.93 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3488  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00705716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  25.93 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>