264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1858 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  44 
 
 		 102 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  40.78 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  40.78 
 
 		 107 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  39.81 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  39.81 
 
 		 107 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  41.67 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  38.83 
 
 		 107 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.76 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  33 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  31.96 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  33.66 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  27 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  33 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  35.48 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  33 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  34.34 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  31.58 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  30.21 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  26.8 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  34.34 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  26.8 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0435  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000949974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  26.8 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  26.8 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  30.93 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  30.93 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  31.31 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  0.0207022 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  30.93 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  42.67 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>