More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2975 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  55.14 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  55.34 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  50.98 
 
 		 118 aa  106  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  46.08 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  46.08 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  35.65 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  38.95 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  37 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  35.78 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  42.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  40.86 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.74 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  30.48 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  37.23 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  37.78 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  38.64 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0264  hypothetical protein  31.07 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0415601  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  37.78 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0055  PadR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3449  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000660793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  41.89 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3242  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.758669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3215  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3470  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3152  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  39.51 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3495  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3456  hypothetical protein  32 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1805  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2720  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2658  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0279  PadR-like family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3295  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.937453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3441  hypothetical protein  31 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1832  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0063  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0062  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  32.1 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3150  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2577  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000426616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2542  hypothetical protein  35.71 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4507  PadR-like family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.718023  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  35.05 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2678  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>