222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1707 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  58.16 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  56.12 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  59.18 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  55.21 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  58.54 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  50.53 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 114 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  51.32 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  46.05 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  49.35 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  41.25 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  41.25 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  41.25 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  38.75 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  38.75 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  38.75 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1270  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  38.75 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  38.67 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  38.57 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  36.49 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  38.96 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 334 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  31.33 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 217 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  28.28 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 128 aa  48.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 123 aa  47.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.33 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.93 
 
 		 263 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  40.54 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>