101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_0882 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  97.12 
 
 		 104 aa  203  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  97.12 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  97.12 
 
 		 108 aa  202  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  98.02 
 
 		 107 aa  200  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  96.15 
 
 		 108 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  96.15 
 
 		 108 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  96.15 
 
 		 104 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  61.39 
 
 		 111 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  63.92 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  92.98 
 
 		 57 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  51.52 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 135 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  50.51 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 107 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 115 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  40.21 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  43.82 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 38 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  43.18 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  36.96 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  37 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  41.38 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  40.26 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  45.83 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  33.71 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 255 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.87 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  33.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 176 aa  42.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 182 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.94 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 334 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 124 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  35.48 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  36.92 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 203 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  37.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 110 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>