92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG2032 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  228  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  61.39 
 
 
104 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  59.81 
 
 
107 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  61.39 
 
 
104 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  61.39 
 
 
108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  61.39 
 
 
108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  61.39 
 
 
108 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  61.39 
 
 
104 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  62.38 
 
 
105 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  61.39 
 
 
104 aa  133  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  58.25 
 
 
106 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  49 
 
 
105 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  50 
 
 
105 aa  101  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  49 
 
 
105 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  49 
 
 
135 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  49 
 
 
105 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  49 
 
 
105 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  49 
 
 
105 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  49 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  46 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  50.5 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  43.69 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  43.88 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  46.32 
 
 
123 aa  88.2  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  43.62 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  42.53 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 
106 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  37.11 
 
 
118 aa  67  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  38.38 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  51.85 
 
 
57 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  76.32 
 
 
38 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  38.71 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  34.74 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  35.42 
 
 
114 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4505  transcriptional regulator, PadR-like family  34.41 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  33.72 
 
 
118 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 
150 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  30.23 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  34.38 
 
 
130 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  28.32 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 
255 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  33.77 
 
 
217 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 
180 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
195 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  30.93 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  30.51 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  27.97 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
152 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  35.06 
 
 
277 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
155 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  30.86 
 
 
112 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  36.07 
 
 
183 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  25.64 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  29.33 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
176 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  31.15 
 
 
121 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>