81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1491 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  213  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  62.38 
 
 		 111 aa  133  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  62.89 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 108 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 104 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  65.98 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  62.89 
 
 		 104 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  62.89 
 
 		 104 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  62.89 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  62.89 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  50.5 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  50.5 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  51 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  51 
 
 		 105 aa  97.1  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  51.69 
 
 		 123 aa  92  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  48.91 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  39.13 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  43.01 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  40.86 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  75.68 
 
 		 38 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  56 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  35.35 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  40.45 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 114 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  30.43 
 
 		 255 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 120 aa  42.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 263 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 176 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4505  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  31.46 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  29.52 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  37.88 
 
 		 251 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 109 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 110 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>