87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2194 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  63.92 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  63.92 
 
 		 107 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 104 aa  123  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  63.92 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  63.92 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  63.92 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  58.25 
 
 		 111 aa  121  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  52.75 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  51.65 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  50.55 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  46.74 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  46.07 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  41.76 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  37.36 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  42.55 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  73.68 
 
 		 38 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  40.43 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  37.89 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  40.23 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1058  transcriptional regulator, PadR family  56.86 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.53908e-38 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3472  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 255 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  41.89 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 240 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  29 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1213  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 251 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 111 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  32.26 
 
 		 106 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  27.4 
 
 		 263 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 226 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1087  PadR-like family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1057  PadR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 334 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1098  PadR-like family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4355  PadR-like family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>