77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1906 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 105 aa  209  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  47.52 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  48.98 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  47.96 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  51.02 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  50 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  48.98 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  48.98 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  48.98 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  43.88 
 
 		 111 aa  90.5  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  47.19 
 
 		 112 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  39.6 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  40.86 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  40.86 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 108 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  41.3 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  41.3 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  41.3 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  49.35 
 
 		 108 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1678  transcriptional regulator, PadR-like family  36.46 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  43.68 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  43.18 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  44.94 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  42.53 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  42.35 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4285  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  58 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1369  transcriptional regulator, PadR-like family  33 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16972  normal  0.5891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.18 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1057  hypothetical protein  55.88 
 
 		 38 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.490589999999999e-38 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 263 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1857  PadR-like family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3153  PadR-like family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 109 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.72 
 
 		 334 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  33.85 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.84 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 150 aa  40  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 150 aa  40  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>