223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3479 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 114 aa  224  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  76.47 
 
 		 124 aa  157  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6088  transcriptional regulator protein-like protein  65.35 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3047  PadR-like family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3679  PadR-like family transcriptional regulator  66.34 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72711  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3566  transcriptional regulator, PadR-like family  63.83 
 
 		 109 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1707  transcriptional regulator, PadR-like family  59.18 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.224855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  61.17 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  59.41 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1475  transcriptional regulator, PadR-like family  57.78 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0705  PadR family transcriptional regulator  58.59 
 
 		 109 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.635439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8548  PadR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3409  transcriptional regulator, PadR-like family  51.69 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35110  predicted transcriptional regulator  50.47 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1146  transcriptional regulator, PadR-like family  56.58 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1175  transcriptional regulator, PadR-like family  40.23 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00041601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04800  transcriptional regulator, PadR family  42.86 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2956  PadR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0295  PadR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2490  transcriptional regulator, PadR-like family  40.91 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  35.05 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1073  hypothetical protein  41 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.808483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0917  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0885  PadR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167704  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0982  hypothetical protein  39.39 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.349108  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1147  transcriptional regulator, PadR family  40 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2802  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.265307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3014  hypothetical protein  38.64 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2228  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.00000000152777 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1906  transcriptional regulator, PadR-like family  44.94 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000539053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4283  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0150167  normal  0.0390672 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1491  PadR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 105 aa  57  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3051  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.492202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2753  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00113864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2734  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3051  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2814  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  43.24 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0901  PadR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00968933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2035  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2194  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  33.33 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2032  hypothetical protein  35.42 
 
 		 111 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  36.14 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  43.42 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0882  PadR-like family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 108 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  34.18 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  44 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 112 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  28.72 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  41.33 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1087  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  34.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  34.94 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  38.64 
 
 		 250 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>