179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1141 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  100 
 
 		 102 aa  207  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  69 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  69 
 
 		 101 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 102 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  47.92 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  43.3 
 
 		 99 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  44.79 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 119 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 115 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  35.38 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  41.89 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  36.27 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  41.94 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  33.85 
 
 		 118 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3479  transcriptional regulator, PadR-like family  34.18 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  36.92 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2592  transcriptional regulator, PadR-like family  29.35 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  29.07 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  32.05 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  37.36 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0180  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  31.91 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  37.36 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  27.96 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  51.28 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  37.36 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  36.9 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  36.9 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  30.65 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  30.77 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  35.94 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1495  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3772  transcriptional regulator, PadR-like family  47.37 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.852524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  34.52 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0473  transcriptional regulator PadR-like protein  45.83 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>