144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2687 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2687  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 119 aa  229  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0613  PadR-like family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 101 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2202  PadR family transcriptional regulator  52 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1141  transcriptional regulator, PadR family  45.1 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.386385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  52.04 
 
 		 107 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0730  PadR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.118827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0216  PadR-like family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2348  PadR family transcriptional regulator  49 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2060  PadR family transcriptional regulator  49 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  48.98 
 
 		 99 aa  96.7  9e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1435  PadR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.666797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4437  transcriptional regulator, PadR-like family  49.48 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.873187 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 100 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  42.39 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4059  PadR-like family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4279  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3958  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4335  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0918  transcriptional regulator, PadR family  35.37 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3947  PadR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  32.08 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4316  transcriptional regulator, PadR family  34.15 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  38 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  37.33 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  37.66 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  33.72 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  35.8 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  46.84 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  35.23 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  35.23 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  33.75 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  33.96 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  33.33 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  43.75 
 
 		 371 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  34.09 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 268 aa  44.3  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2897  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.743193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2018  PadR-like family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5527  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  34.25 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  34.25 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0141  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.990112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  34.25 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  34.25 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  43.06 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  38.98 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  33.72 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  30.68 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  31.17 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 180 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  27.66 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  46.55 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3562  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  34.57 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  37.29 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  32.88 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>