45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2589 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  90.76 
 
 		 119 aa  223  8e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  68.38 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  67.52 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  62.71 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  63.89 
 
 		 92 aa  91.3  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  62.5 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  59.72 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  55.42 
 
 		 91 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  47.12 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  59.72 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  54.22 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  52.87 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  59.72 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  59.72 
 
 		 91 aa  85.5  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  60.27 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  54.22 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  51.85 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  60.27 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  48.78 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  47.62 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  46.99 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  48.31 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  41.07 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  56.45 
 
 		 78 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  50.68 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  45.12 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  48.61 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 263 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  37.14 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  39.71 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1330  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 240 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.855689  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>