33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4301 on replicon NC_013925
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  53.26 
 
 		 119 aa  94.7  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  48.54 
 
 		 119 aa  90.5  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  44.55 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  47.52 
 
 		 110 aa  88.6  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  47.87 
 
 		 119 aa  87.8  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  47.12 
 
 		 119 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 91 aa  85.5  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  47.37 
 
 		 91 aa  85.1  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 93 aa  84  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  46.32 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  40.78 
 
 		 97 aa  81.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  46.15 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  45.05 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  43.33 
 
 		 90 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  44.09 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  43.62 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  46.25 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  42.55 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  45.71 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>