33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4072 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  85.87 
 
 		 93 aa  166  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  88.76 
 
 		 92 aa  164  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  78.95 
 
 		 97 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  83.15 
 
 		 91 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  86.52 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  86.52 
 
 		 91 aa  157  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  86.52 
 
 		 91 aa  157  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  85.39 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  80.9 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  77.53 
 
 		 91 aa  149  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  57.3 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  58.14 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  56.18 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  61.8 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  51.09 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  56.63 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  54.12 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  59.21 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 119 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  54.22 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  55.42 
 
 		 119 aa  84  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  60.27 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  47.31 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  47.78 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>