36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0429 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 90 aa  184  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  86.67 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  85.56 
 
 		 90 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  84.44 
 
 		 91 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  85.56 
 
 		 91 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  81.11 
 
 		 91 aa  156  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  82.22 
 
 		 91 aa  155  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  83.33 
 
 		 91 aa  141  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  67.42 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 92 aa  129  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  76.62 
 
 		 78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  64.44 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 97 aa  126  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  64.44 
 
 		 92 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  62.92 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  59.77 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  57.65 
 
 		 99 aa  105  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  55.68 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  49.41 
 
 		 97 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 119 aa  84.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  46.99 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  45.45 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  25.58 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0560  transcriptional regulator, PadR-like family  38.1 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>