34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3648 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 99 aa  204  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  65.98 
 
 		 97 aa  136  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  58.7 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  61.63 
 
 		 92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  61.63 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  61.63 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  59.34 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  59.77 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  60.47 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  61.63 
 
 		 91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  60.47 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  54.35 
 
 		 93 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  54.26 
 
 		 91 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  58.14 
 
 		 95 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  58.82 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  57.65 
 
 		 90 aa  105  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  58.82 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  58.14 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  56.47 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  53.41 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  53.33 
 
 		 110 aa  97.1  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  54.65 
 
 		 91 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  53.57 
 
 		 91 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  58.33 
 
 		 91 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  52.87 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  51.72 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  48.86 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  48.28 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  50.68 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  46.67 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  30.61 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>