34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4611 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  83.33 
 
 		 90 aa  159  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  81.32 
 
 		 91 aa  157  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  82.42 
 
 		 91 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  83.33 
 
 		 90 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  81.11 
 
 		 91 aa  152  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  81.11 
 
 		 91 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  75.82 
 
 		 91 aa  147  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  67.03 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  67.03 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  127  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  67.78 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  64.44 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  62.22 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  73.08 
 
 		 78 aa  120  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  61.8 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  60.44 
 
 		 91 aa  117  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  60.23 
 
 		 110 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  54.26 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  52.94 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  51.16 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  45.12 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  44.58 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  42.22 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  26.25 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>