36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2257 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  86.67 
 
 		 90 aa  166  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  85.71 
 
 		 91 aa  164  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  84.62 
 
 		 91 aa  163  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  86.67 
 
 		 90 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  85.56 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  80.22 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  81.32 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  69.23 
 
 		 91 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  82.05 
 
 		 78 aa  133  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  67.03 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  68.13 
 
 		 92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  68.13 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  67.03 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  68.89 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  65.93 
 
 		 91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  67.42 
 
 		 97 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 92 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  63.22 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  58.82 
 
 		 99 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  55.68 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  50.59 
 
 		 97 aa  95.9  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  46.99 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  45.56 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0560  transcriptional regulator, PadR-like family  40.28 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.4185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>