38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4837 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 91 aa  188  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  89.01 
 
 		 91 aa  171  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  83.52 
 
 		 91 aa  161  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  80.22 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  82.22 
 
 		 90 aa  155  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  78.89 
 
 		 90 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  78.02 
 
 		 91 aa  150  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  67.42 
 
 		 91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 92 aa  131  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  130  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  75.64 
 
 		 78 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  61.54 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 97 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  62.64 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  75.82 
 
 		 91 aa  126  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  65.56 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  62.64 
 
 		 92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  63.74 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  64.04 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  61.8 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  60.92 
 
 		 110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  54.26 
 
 		 99 aa  107  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  52.94 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  52.27 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  47.62 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 119 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.71 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2066  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0383974  normal  0.155054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>