35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5176 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 91 aa  189  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  90.11 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  89.01 
 
 		 91 aa  171  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  84.62 
 
 		 91 aa  163  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  84.44 
 
 		 90 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  83.52 
 
 		 91 aa  159  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  83.33 
 
 		 90 aa  158  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  68.54 
 
 		 91 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  81.11 
 
 		 91 aa  133  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  67.03 
 
 		 91 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  78.21 
 
 		 78 aa  130  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 92 aa  130  6e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  68.89 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  65.93 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  65.93 
 
 		 91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 97 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 93 aa  127  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 92 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  64.84 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  65.17 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  64.37 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  58.82 
 
 		 99 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  53.93 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  54.12 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  52.44 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  45.05 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  31.4 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.05 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>