48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0305 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  75.63 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  67.52 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 119 aa  153  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  47.12 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  54.88 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  51.11 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  52.44 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  54.88 
 
 		 91 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  52.44 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  44.55 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  51.22 
 
 		 92 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  53.66 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  48.89 
 
 		 93 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  46.6 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 90 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  48.78 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  48.86 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 91 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  58.06 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  48.31 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  47.13 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  48.61 
 
 		 91 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  46.34 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0067  PadR-like family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.995572  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  39.13 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  36.46 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2066  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0383974  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 185 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0940  transcriptional regulator, PadR-like family  39.19 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.795743  normal  0.552742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  37.36 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  32.95 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 110 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>