35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1205 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1205  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3064  transcriptional regulator, PadR-like family  70.69 
 
 		 119 aa  173  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0311  transcriptional regulator, PadR-like family  63.56 
 
 		 119 aa  157  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2589  transcriptional regulator, PadR-like family  62.71 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0305  transcriptional regulator, PadR-like family  66.67 
 
 		 119 aa  153  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.867238  normal  0.137028 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5176  transcriptional regulator, PadR-like family  52.38 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.221427  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5079  transcriptional regulator, PadR-like family  48.42 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0854427  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4301  transcriptional regulator, PadR-like family  47.87 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2749  transcriptional regulator, PadR-like family  49.44 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2941  transcriptional regulator, PadR-like family  51.81 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.245813  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3008  transcriptional regulator, PadR-like family  50.6 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0934248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2296  transcriptional regulator, PadR-like family  51.81 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.61746  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1693  transcriptional regulator, PadR-like family  51.81 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2210  transcriptional regulator, PadR-like family  50.6 
 
 		 92 aa  84  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0780197  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4837  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0429  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2257  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3614  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0855462  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4776  transcriptional regulator, PadR-like family  50.6 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3619  transcriptional regulator, PadR-like family  51.81 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2198  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4053  transcriptional regulator, PadR-like family  49.4 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4825  transcriptional regulator, PadR-like family  48.19 
 
 		 90 aa  80.5  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3648  transcriptional regulator, PadR-like family  48.28 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4915  transcriptional regulator, PadR-like family  45.78 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4072  transcriptional regulator, PadR-like family  47.31 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0723  transcriptional regulator, PadR-like family  47.56 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2671  transcriptional regulator, PadR-like family  45.12 
 
 		 91 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338912  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4967  transcriptional regulator, PadR-like family  55.56 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.598171  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4611  transcriptional regulator, PadR-like family  48.61 
 
 		 91 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3315  transcriptional regulator, PadR-like family  44.32 
 
 		 97 aa  72  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2947  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2907  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0960703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>