178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0115 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 372 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1168  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1507  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  45.33 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  31.48 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  35.53 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3684  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 371 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  39.29 
 
 		 226 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  44.44 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 229 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  42.65 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  40.3 
 
 		 210 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1173  PadR-like family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 195 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 215 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 182 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 195 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 236 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  32.14 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  35 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  46.43 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  35.14 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  29.47 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 277 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  33.68 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  35.14 
 
 		 197 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 207 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  32.22 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  31.08 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 250 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  37.65 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  28.16 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  33.68 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3164  PadR-like family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  32.95 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>