162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1018 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  38.36 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 372 aa  58.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2519  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  32 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  26.88 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  27.85 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  27.54 
 
 		 251 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1507  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  41.1 
 
 		 118 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 255 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  30.69 
 
 		 219 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2649  PadR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 207 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00573866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  30.92 
 
 		 263 aa  50.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2857  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  44.07 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  37.21 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  30.58 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1225  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  39.73 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  39.06 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  39.68 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  36.23 
 
 		 316 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2975  PadR-like family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351973  hitchhiker  0.000108839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  28.67 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  26.71 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 		 271 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 236 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  32.94 
 
 		 117 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3107  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 103 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 181 aa  47.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  41.27 
 
 		 277 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  35.71 
 
 		 99 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1313  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107904  normal  0.0202461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  24.38 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0961  transcriptional regulator, PadR-like family  27.45 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  38.37 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  32.11 
 
 		 114 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  32 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  31.63 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4772  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4665  PadR-like family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4120  PadR-like family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.71 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  34.57 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  29.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  29.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 107 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  47.83 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 305 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 121 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1127  transcriptional regulator, PadR-like family  26.81 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.272807 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>