131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1805 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  233  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  72.65 
 
 		 117 aa  180  7e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  37.62 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0529  transcriptional regulator, PadR-like family  34.26 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  31.96 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1448  PadR-like family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  37.84 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0563  PadR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  35.35 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  31.46 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  32.61 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  29.9 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  29.9 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  31.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  28.87 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  39.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  30.39 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2218  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0332855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  28.87 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05700  transcriptional regulator, PadR family  34.18 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 181 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  30.1 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  26.97 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1031  transcriptional regulator, PadR-like family  27.84 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.0578877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  36.25 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  29.9 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29.25 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  29.25 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  29.25 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  35.23 
 
 		 212 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  29.25 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  29.17 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09563  hypothetical protein  44.23 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.193917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  32.14 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  29.25 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  29.25 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  29.25 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 138 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>