264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2137 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  64.76 
 
 		 224 aa  260  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  70.79 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  63.11 
 
 		 212 aa  248  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  63.13 
 
 		 201 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  64.61 
 
 		 227 aa  234  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  68 
 
 		 229 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  64.2 
 
 		 212 aa  232  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  59.5 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  59.49 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  68.02 
 
 		 272 aa  208  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  58.56 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 187 aa  188  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  57.87 
 
 		 249 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  57.56 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  53.11 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  58.38 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  51.21 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 181 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  53.8 
 
 		 180 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 181 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  54.64 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  54.12 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  50 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  40.43 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  36.17 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  38.1 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.22 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  26.22 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.22 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  32.33 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.48 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  39.02 
 
 		 114 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 107 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  25.45 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  29.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 154 aa  52.8  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  26.29 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1021  transcriptional regulator, PadR-like family  31.72 
 
 		 148 aa  51.6  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  28.79 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  40.74 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  29.94 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  40.58 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 114 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1141  transcriptional regulator, PadR-like family  34.15 
 
 		 151 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  28.88 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 372 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 168 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0115  PadR-like family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 118 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00621123  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.15 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  42.11 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 114 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  41.25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 110 aa  48.9  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  29.25 
 
 		 255 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  37.8 
 
 		 121 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.63 
 
 		 114 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>