81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0979 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  96.49 
 
 		 171 aa  338  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  54.79 
 
 		 148 aa  157  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  46.45 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  38.04 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  45.03 
 
 		 166 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  36.2 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  35.85 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  32.67 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  23.95 
 
 		 325 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  28.05 
 
 		 176 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  31.29 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  24.54 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  24.54 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  27.82 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  31.19 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  27.07 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  27.68 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.04 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  27.68 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  26.98 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3907  PadR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.67 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  27.56 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  27.55 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  32.63 
 
 		 175 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.25 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  29.45 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.66 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  29.45 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  23.21 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  24.29 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.01 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 180 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 183 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  43.86 
 
 		 277 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  26.58 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  32.32 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>