177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2526 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  30.06 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  38.79 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  34.19 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.86 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  32.79 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.06 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  24.71 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  35.71 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  27.49 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  31.3 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  26.29 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  36.78 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  29.59 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  23.73 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  30.61 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  32.63 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  35.79 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  24.42 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  23.08 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  26.26 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  29.46 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  20.5 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 242 aa  51.2  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  21.76 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  29.31 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  32.58 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  29.6 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 102 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  32.38 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  31.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.5 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  27.35 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  28.28 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 123 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  20.9 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1068  transcriptional regulator, PadR family  32.47 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  32.43 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 119 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>