56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2867 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  58.77 
 
 
248 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  58.77 
 
 
248 aa  263  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  58.77 
 
 
221 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  57.14 
 
 
227 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  50.87 
 
 
223 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  35.33 
 
 
212 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.9 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  37.23 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  34.91 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 
160 aa  58.2  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  26.72 
 
 
184 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  29.69 
 
 
179 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 
186 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 
185 aa  55.1  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  33.05 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  31.85 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
173 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
173 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  32.35 
 
 
179 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  32.18 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  41.67 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  31.37 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  31.37 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  32.09 
 
 
175 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  36.14 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  31.36 
 
 
184 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  37.38 
 
 
176 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  31.75 
 
 
186 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  36.04 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  29.29 
 
 
179 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31.15 
 
 
177 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.35 
 
 
168 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  38.57 
 
 
176 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.67 
 
 
168 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  34.91 
 
 
174 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  33.02 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  34.57 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.43 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  27 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  27.5 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  36.76 
 
 
181 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  35.06 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  28.14 
 
 
191 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  28.14 
 
 
171 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.73 
 
 
174 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 
242 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.786766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>