164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1318 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  41.76 
 
 		 182 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  35.19 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.95 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  26.9 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  30.1 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  29.84 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.22 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  38.37 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  24.86 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  29.13 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  25.83 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  34.82 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  26.61 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  25 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  31.67 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  28.02 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  26.61 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.52 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  30.49 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  31.34 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  23.03 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  28.71 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  20.55 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  28.74 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  24.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  26.98 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0386  hypothetical protein  28.18 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0499136  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  43.48 
 
 		 121 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  38.89 
 
 		 121 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  23.39 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  34.55 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  23.12 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 182 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  29.13 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  26.14 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.14 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  37.18 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  25.84 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  27.07 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 110 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  25.29 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  23.84 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  26.9 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.82 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 109 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  23.59 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  31.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  31.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  20.12 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  20.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  29.25 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 110 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  22.5 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0895  transcriptional regulator PadR family protein  30.86 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.036663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  31.65 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>