126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13740 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  411  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  37.91 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  30.6 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.19 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  29.19 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.6 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  35 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  32.14 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  35.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.73 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  26.61 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  35.44 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.5 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.5 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.5 
 
 		 165 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.5 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.5 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  21.88 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  30.58 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 242 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  31.88 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.19 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  25.36 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.67 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  28.74 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  31.4 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  32.56 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  23.64 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 172 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.69 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30.25 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  25.88 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  29.81 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  26.74 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  26.61 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  31.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 112 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  35.58 
 
 		 112 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  27.36 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 120 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  28.44 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  29.07 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  29.07 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  24.27 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  26.32 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  35.19 
 
 		 128 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  26.21 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 125 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>