186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_1669 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  99.44 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  98.88 
 
 		 179 aa  357  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  95.98 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  92.18 
 
 		 179 aa  308  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  41.67 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 242 aa  87.8  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  26.19 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  33.65 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  30.46 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  34.96 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  32.69 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 325 aa  64.3  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  21.71 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  30.61 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.74 
 
 		 305 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  33.01 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.78 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2808  PadR-like family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  34.95 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13740  predicted transcriptional regulator  24.73 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  23.62 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  31 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  32.05 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  28 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  36.9 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  37.11 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  26.61 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06690  predicted transcriptional regulator  32.5 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000111873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  25.23 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  32.1 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05950  predicted transcriptional regulator  25.97 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  25.2 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 118 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  35.44 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25.55 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  32.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4568  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.167049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  30.49 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5790  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 128 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.120681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  32.1 
 
 		 252 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  25.93 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.04 
 
 		 174 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  37.84 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  29.91 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1401  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2892  PadR-like family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4192  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  33.82 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  23.93 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>