115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4729 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3646  transcriptional regulator, PadR-like family  38.59 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  35.64 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  37.64 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  32.6 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  29.03 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  29.89 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  36.84 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  27.87 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  32.74 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  32.64 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  30.41 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  26.49 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  29.08 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  24.6 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  29.08 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  28.16 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  27.94 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  33.94 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  22.45 
 
 		 325 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  44.83 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  26 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  30.97 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 173 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  26.82 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.5 
 
 		 305 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  40.48 
 
 		 117 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  24.58 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  45.28 
 
 		 172 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  19.67 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31.45 
 
 		 177 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  26.4 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  34.17 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  26.36 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  27.42 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  26.4 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 121 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  27.45 
 
 		 109 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  45.1 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  27.87 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  23.59 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  26.09 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 181 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  40.38 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  27.27 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  34.07 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  26.98 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  47.06 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 316 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  26.4 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  41.27 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  26.22 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  39.66 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  29.9 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.62 
 
 		 263 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>