150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1415 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  62.43 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  63.25 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  55.5 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  56.98 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  57.47 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  53.26 
 
 		 222 aa  196  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  53.55 
 
 		 242 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  47.46 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  45.05 
 
 		 194 aa  137  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  40.83 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  34.91 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  39.77 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  39.18 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  36.2 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  36.09 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 170 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  37.08 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  34.07 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  34.97 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  34.42 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  33.74 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  29.19 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  34.86 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  31.28 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4729  transcriptional regulator, PadR-like family  32.64 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.09 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  35.64 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  34.31 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 305 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  28.49 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  28.9 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  34.69 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  26.47 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  27.23 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  37.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  32.14 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  27.22 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  33.03 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 176 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  35.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  37.66 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  28.78 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  32.28 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  41.79 
 
 		 250 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  35.04 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.33 
 
 		 334 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 263 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  35.29 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  29.25 
 
 		 325 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 226 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.35 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  28.23 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  28.81 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  32.63 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  33.98 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  35 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  32.69 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>