201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2179 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  51.69 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  50.29 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  40.49 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  22.35 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  31.97 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  23.89 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  28.9 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  28.33 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  29.02 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.59 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  26.16 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  31.87 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.67 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  28.29 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 111 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  21.55 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  23.7 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  25.43 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  27.41 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  23.86 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  24.86 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  51.2  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  23.12 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  32.26 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  30.59 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  27.65 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  29.76 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  21.55 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 109 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 109 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.18 
 
 		 110 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  21.55 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  32.26 
 
 		 107 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  33.33 
 
 		 114 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 113 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  20.99 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  25.7 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  36.47 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  26.7 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 110 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24890  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  20.99 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 103 aa  48.5  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  35.71 
 
 		 181 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  26.73 
 
 		 325 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 107 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  24 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  20.99 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  20.99 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  28.05 
 
 		 110 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  20.99 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  28.05 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  25.93 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  20.99 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  28.87 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1805  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0386  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0499136  normal  0.0189876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>