125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4863 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 186 aa  373  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  52.41 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0916  PadR-like family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0979  transcriptional regulator PadR family protein  36.2 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.334428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07680  predicted transcriptional regulator  34.23 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0943  transcriptional regulator, PadR-like family  33.11 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  29.24 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1864  hypothetical protein  28 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00461724  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  32.1 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  31.76 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  29.3 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  30.91 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  28.68 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  32.97 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  33.06 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  28.24 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  31.45 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.75 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  27.12 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  23.26 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  26.47 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  27.22 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  26.42 
 
 		 305 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  29.03 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  31.93 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3907  PadR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  36.36 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 174 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  32.17 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  39.24 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  35.96 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5605  PadR-like family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0554701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3145  PadR-like family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.64 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  29.24 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  31.09 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0288  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0298  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 248 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0279  PadR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  25.69 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  24.03 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  34.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  37.35 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  38.64 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  30.16 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  37.08 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  33.98 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  29.69 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  23.84 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  34.29 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  28.75 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  31.01 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0499136  normal  0.0189876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  37.5 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  26.88 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>