121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7926 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  74.29 
 
 		 175 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  75.15 
 
 		 170 aa  253  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  59.77 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  59.17 
 
 		 174 aa  191  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  58.96 
 
 		 176 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  56.9 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  55.88 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  52.94 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  52.66 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  49.38 
 
 		 176 aa  124  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  40.49 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  36.47 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  35.75 
 
 		 202 aa  94  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  38.32 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  35.29 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  35.43 
 
 		 222 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  35.39 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  35.93 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  35.03 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.35 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.9 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  34.56 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  35.03 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  24.24 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  27.93 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  32.14 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  34.48 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  23.4 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.54 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1205  PadR-like family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 120 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  28.75 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  32.71 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  29.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  30 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4418  PadR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 114 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4436  PadR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 253 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4828  30S ribosomal protein S14 homolog-related  35.53 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4516  PadR-like family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 114 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  29.69 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  29.22 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  34.85 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  29.17 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  35.48 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  35.87 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2867  PadR-like family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 215 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  27.54 
 
 		 232 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2546  PadR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4572  PadR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 191 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  28.31 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  29.07 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  26.42 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4803  transcriptional regulator, PadR family  42.86 
 
 		 86 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  32.53 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  24.42 
 
 		 185 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 179 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>