154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4637 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  46.88 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  45 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  42.42 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  43.75 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  45.81 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7926  transcriptional regulator, PadR-like family  40.49 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 179 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0527  PadR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1343  transcriptional regulator PadR family protein  40.28 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  39.38 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  44.16 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  40.37 
 
 		 210 aa  99.4  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  34.86 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  38.04 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  33.14 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  33.74 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.95 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  33.71 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  32.52 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  33.13 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  31.21 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  20.21 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 160 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8856  transcriptional regulator, PadR family  35.63 
 
 		 109 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  31.93 
 
 		 172 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  28.93 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  21.26 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  29.01 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  20 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  27.13 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  38.75 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  23.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  31.65 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  20 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.67 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  28.75 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  27.59 
 
 		 305 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  25.61 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  21.26 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  22.35 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  22.35 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  22.35 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  22.35 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 109 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  30.68 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  29.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  34.69 
 
 		 252 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  34.78 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 190 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  27.88 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 226 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  50.91 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  45.33 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>