93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3285 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  53.11 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  52.54 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  47.93 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  47.75 
 
 		 226 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  41.28 
 
 		 215 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  39.31 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  38.33 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  37.29 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  37.78 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  38.65 
 
 		 206 aa  104  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 		 202 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  34.64 
 
 		 201 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  37.85 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  36.99 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  34.86 
 
 		 232 aa  94.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 209 aa  94.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  23.73 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  23.16 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  23.16 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  27.33 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  23.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  23.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  23.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  23.16 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  29.27 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  33.02 
 
 		 168 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  29.08 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  37.63 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  27.21 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 242 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  32.93 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  35.35 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  30.5 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  31.39 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  24.14 
 
 		 325 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  25.19 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  25.55 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  29.41 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  30.16 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2234  PadR-like family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156481  decreased coverage  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 175 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  29.76 
 
 		 187 aa  41.2  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4871  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4960  PadR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 220 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  31.52 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>