80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4755 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 196 aa  384  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  57.46 
 
 		 203 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  36.11 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  37.16 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  36.08 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  36.96 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  39.25 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 220 aa  98.6  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  35.75 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.76 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  34.43 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 215 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  32.45 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  29.21 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.7 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  30.98 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  30.17 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.71 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.71 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  25.73 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  27.65 
 
 		 325 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  23.53 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  41.56 
 
 		 113 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  30.53 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  22.94 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  24.28 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  22.94 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  22.94 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  22.94 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  27.91 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  31.55 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  25.34 
 
 		 176 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  29.73 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  22.35 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  21.76 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  21.76 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  21.76 
 
 		 185 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  21.76 
 
 		 185 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  30.38 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.41 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  31.93 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 242 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1201  PadR-like family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 132 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695362  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  30.07 
 
 		 206 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  30.67 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  34.83 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>