99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3223 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  41.97 
 
 		 232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  43.63 
 
 		 203 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 180 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 209 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.98 
 
 		 202 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  43.1 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 198 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 204 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  36.26 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  38.76 
 
 		 201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  34.76 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 190 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  41.27 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  37.43 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  39.25 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  27.78 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  29.88 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  38.46 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 179 aa  62  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  33.9 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  26.82 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  29.1 
 
 		 179 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  20.11 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  25.85 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  19.55 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 272 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  18.99 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  27.27 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  27.27 
 
 		 185 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  25.93 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  31.62 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 111 aa  46.2  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  19.13 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  19.13 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  22.87 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  18.99 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 216 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  18.99 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  27.91 
 
 		 174 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2227  PadR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 101 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  24.4 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  20.24 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.66 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  23.12 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  32.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  29.41 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  26.77 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  22.48 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  24.32 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06230  predicted transcriptional regulator  28.03 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.946193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  20.24 
 
 		 165 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  30.95 
 
 		 109 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  24.26 
 
 		 176 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 183 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  25.47 
 
 		 168 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  20.24 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>