91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0122 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  99.47 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  93.12 
 
 		 190 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  93.12 
 
 		 190 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  93.12 
 
 		 190 aa  354  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  92.06 
 
 		 190 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  89.42 
 
 		 190 aa  341  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 213 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  63.44 
 
 		 218 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  64.32 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  46.74 
 
 		 226 aa  150  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 180 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  43.01 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  43.78 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  34.97 
 
 		 232 aa  117  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  35.36 
 
 		 203 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  39.78 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 209 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  35.15 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  37.2 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  36.87 
 
 		 201 aa  101  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  37.02 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  32.79 
 
 		 232 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  35.33 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 253 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  35.54 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  26.44 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  23.66 
 
 		 185 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.11 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  27.68 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  30.41 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1958  transcriptional regulator, PadR-like family  34 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  29.46 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  22.58 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  22.04 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0811  PadR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  31.95 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  28.48 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  29.7 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  22.58 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  27.01 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  23.91 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  35.16 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  32.73 
 
 		 174 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  31.11 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1924  PadR-like family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000157099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  22.04 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  22.04 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  32.85 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  39.47 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  41.49 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  22.04 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  22.04 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  30.3 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  28.4 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4387  transcriptional regulator  30.22 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.0793988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.12 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  27.34 
 
 		 175 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1318  transcriptional regulator, PadR-like family  31.19 
 
 		 185 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 		 128 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0701  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  30.86 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0828  transcriptional regulator, PadR-like family  27.11 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.845057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>