81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0784 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  38.65 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3222  transcriptional regulator, PadR-like family  34.59 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0117  PadR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  41.03 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  31.36 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4202  transcriptional regulator, PadR-like family  39.66 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1777  hypothetical protein  30.18 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354573 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  31.21 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3045  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0118397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  28.3 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  32.46 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 187 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  29.28 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  31.09 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  30.83 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  33.9 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  25 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  29.25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  29.14 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  26.55 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  24.29 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  25.71 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  28.9 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  26.23 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  26.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  33.08 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.51 
 
 		 168 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 181 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  26.98 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  26.87 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  26.54 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 168 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  32.94 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  28.36 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  34.44 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  25.93 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  26.95 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  32.18 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>