96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0887 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1487  transcriptional regulator, PadR-like family  46.96 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.241527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  43.1 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5813  PadR-like family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6124  PadR-like family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372402  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3549  transcriptional regulator, PadR-like family  38.3 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.353373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0152  putative PadR transcriptional regulator  37.17 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.762671  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2974  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3036  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4021  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3948  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1565  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3335  PadR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3285  PadR-like family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.400255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5591  transcriptional regulator, PadR-like family  35.12 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0098  transcriptional regulator, PadR family  36.7 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.846374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  31.58 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  37.43 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2708  PadR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3292  PadR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4389  PadR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0112  PadR-like family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0122  PadR-like family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.270668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0957  transcriptional regulator, PadR-like family  33.88 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0586102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0813  transcriptional regulator, PadR-like family  39.55 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0121  PadR-like family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4755  transcriptional regulator, PadR-like family  32.45 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.208471  hitchhiker  0.00173659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3302  PadR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0122  PadR-like family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2933  PadR-like family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.568859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0136  PadR-like family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3006  PadR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3170  transcriptional regulator, PadR family domain protein  31.08 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3185  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0506611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8807  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  32.5 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4892  PadR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3830  PadR-like family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4125  hypothetical protein  36.84 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0396692  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  31.5 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1133  transcriptional repressor PadR  34.21 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  normal  0.874315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4106  transcriptional repressor PadR  34.21 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.322832  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4052  hypothetical protein  35.53 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166884  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4233  PadR-like family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3759  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.779947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4019  hypothetical protein  34.21 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4217  hypothetical protein  34.21 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000647114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3743  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898433  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3911  hypothetical protein  34.21 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000121326  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1727  PadR-like family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.765397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0784  transcriptional regulator, PadR-like family  26.55 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1578  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  34.23 
 
 		 178 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  34.27 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1786  transcriptional regulator, PadR-like family  28.24 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  32.79 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  27.16 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  30.28 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1531  transcriptional regulator PadR family protein  27.52 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 126 aa  45.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4637  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0904166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.25 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1371  transcriptional regulator, PadR-like family  23.86 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0218081  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  27.81 
 
 		 174 aa  44.7  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1537  PadR-like family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0057  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 168 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1895  PadR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 121 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 111 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1925  PadR-like family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 118 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  26.92 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0301  transcriptional regulator, PadR-like family  29.09 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 111 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 165 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 152 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  32.41 
 
 		 191 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 107 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  37.68 
 
 		 113 aa  42  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  25.97 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0364  transcriptional regulator, PadR-like family  30.08 
 
 		 186 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  30.26 
 
 		 168 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  39.51 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 185 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1562  transcriptional regulator, PadR-like family  30 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.553173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 109 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.71 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>