52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3190 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3190  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 107 aa  210  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0392978  normal  0.0453755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1476  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3490  transcriptional regulator, PadR-like family  44.3 
 
 		 108 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5372  transcriptional regulator, PadR-like family  37.86 
 
 		 100 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5040  PadR-like family transcriptional regulator  39 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3569  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1666  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  38.24 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  38.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  36.59 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0909  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2803  transcriptional regulator, PadR-like family  41.54 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  29.59 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4876  transcriptional regulator, PadR-like family  35.63 
 
 		 226 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  33.73 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  36.51 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.46 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  30.53 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1887  transcriptional regulator PadR family protein  45.61 
 
 		 232 aa  42.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  32.98 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2773  transcriptional regulator PadR family protein  38.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.480734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2716  PadR-like family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0032771  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 202 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 108 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 110 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0887  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 206 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.84074  normal  0.410025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8333  transcriptional regulator, PadR-like family  34.82 
 
 		 118 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3375  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695283  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3013  transcriptional regulator, PadR-like family  42.17 
 
 		 109 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00626511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 111 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  39.39 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  29.76 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  34.21 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 186 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0467  transcriptional regulator PadR family protein  44.68 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.560636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0216  transcriptional regulator, PadR-like family  32.39 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0894  transcriptional regulator PadR-like protein  32.93 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3281  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.206991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3584  PadR-like family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>